迪恩（简森·阿克斯 Jensen Ackles 饰）和萨姆（贾德·帕达里克 Jared Padalecki 饰）终于找到父亲约翰（杰弗瑞·迪恩·摩根 Jeffrey Dean Morgan 饰），但为了救迪恩，约翰甘愿深上天狱，留下兄弟两个继续实现“猎人”职责。同时兄弟俩…

美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾经历一路离奇神秘的绑架案，他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持，至今着落不明。从此穆德便专注于神秘事务的研究，并专门负责FBI总部的X档案部门。因穆德行事乖张，…

穆德远途调查出了不测，在神经病院醒来有了预见的能力，还能读取他人的心理流动。史考莉在非洲海岸发明那里发明了刻有人类基因图的远古遗物及关于第六次物种大灭绝的记载。　　癌人一向在进行外星混血儿的试验，注入病毒已磨练是否胜利，…

穆德（David Duchovny 大卫•杜楚尼 饰）被外星叛逆者劫持，而斯科莉（Gillian Anderson 吉莲•安德森 饰）亦同时发明自己怀有身孕。穆德的办公室被搜查，斯科莉请求Skinner（Mitch Pileggi 饰）赞助寻觅搭档，孤枪侠也介入进来。…

在影戏FTF里出现的变种alien从一个基因手艺研究公司的员工肚子里钻出来逃跑了。Mulder和Scully找到了Gibson，他带Mulder去找那个alien。Scully证明出Gibson可能是外星人（所有人类都可能是）。X档案如今由Spender和Fowley…

继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，实时觉察错误后和史考莉通同好来骗当局高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别捕快不应进入的处所”汇集需要的资料。本季成长越来越精彩，一些没有被完整革新的混血外星人联合起来反抗殖民阴谋。…

美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾经历一路离奇神秘的绑架案，他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持，至今着落不明。从此穆德便专注于神秘事务的研究，并专门负责FBI总部的X档案部门。因穆德行事乖张，…

福斯托和纳丁在巴黎一家酒店第一次认识，他们都很脆弱，伶仃，渴望拥有幸运。福斯托是移居法国的意大利人，作为一个办事员他进展自己能有所作为，但一向未果，而纳丁是一个年青而美丽的法国姑娘。他们双双坠入爱河，两人的命运从此交叉在…

外星人与当局的阴谋随着逼近大结局而越来越彰着。大结局《真相》(The Truth)里，穆德获得线报又回来寻觅真相了，可是他却因同超级兵士的搏斗而被关进了监狱，控以谋杀，接管审讯。可是穆德否定指控，由于简单手段根本杀不死超级兵士。道…