继上一次的怪兽高燃对战以后，金刚和哥斯拉将再度联手匹敌一个潜伏活着界中的庞大威逼，并逐步探索这些巨兽们的起源以及骷髅岛等地的奥秘。同时，上古之战的面纱也将会被揭晓，而正是那场战役缔造出了这些超凡的生物，并深刻影响了人类世…